Levere data til Artsprosjektet
Som del av Artsprosjektet er det viktig å dele artsfunn på en strukturert måte. Her finner du retningslinjer for rapportering, datalevering, artsnavn og lisenser, slik at dataene dine blir en verdifull ressurs for forskning og forvaltning av naturmangfoldet i Norge.
Innhold
Artslister og navn
Artslister og navn som deles med Artsdatabanken inngår i vårt navneregister Nortaxa. Alle våre tjenester henter navn herfra. Navneregisteret fungerer som referansemateriale for riktig bruk av navn på arter i forvaltning og forskning.
Innholdet i artslistene
Artslistene leveres i tabellformat og skal inneholde opplysninger om artsnavn og autor. De obligatoriske hierarkiske nivåene som må fylles ut er: rike – rekke – klasse – orden – familie – slekt – art, samt eventuelle underartsnivåer.
For hvert takson skal det oppgis om arten er:
- ny for vitenskapen
- ny for Norge
- funn av en art som tidligere ble antatt forsvunnet fra Norge
- funn av art som er tidligere registrert i Norge
Merk: Kun én av disse opplysningene per takson skal brukes for å sikre entydig statistikk. Et kommentarfelt kan brukes ved behov for ytterligere forklaringer.
Rapportering av arter nye for vitenskapen
Når arter er nye for vitenskapen, må fullt artsnavn og autor oppgis, sammen med litteraturreferanse der arten først ble beskrevet. Det er viktig å følge regelverket for den aktuelle artsgruppen:
- International Code of Nomenclature for Algae, Fungi and Plants
- International Code of Zoological Nomenclature
Hvis navnet ennå ikke er publisert, oppgis arten med slektsnavn + “sp. nov.”. Det bør da legges til en kommentar om planlagt publisering: hvor og når navnet skal publiseres i henhold til regelverket.
Prosjektet har ansvar for å informere Artsdatabanken når nye vitenskapelige navn publiseres, selv om dette skjer lenge etter prosjektets slutt.
Sammenligning mot Artsdatabankens navneregister
Før rapportering bør artslistene sammenlignes med innholdet i navneregisteret Nortaxa gjennom listesøket.
Dette hjelper med å:
- identifisere ny informasjon som bør vurderes for innlegging i navneregisteret,
- rette skrivefeil i listene, og
- sikre at artsnavnene er konsistente med registrert informasjon.
Prosjektet bør opplyse i rapporten dersom en slik sammenligning ikke er gjennomført. Man kan også eksportere parameteren “finnes i Norge” i søket for å se hvilke arter som allerede er registrert i Norge.
Verktøy og hjelpemidler
- Navnevask: kontrollerer artslister mot Artsdatabankens navneregister.
- Listesøk artsnavn: sammenligning mot Nortaxa og eksport av relevante parametere.
DNA-strekkoder
Alle kartleggingsprosjekter i regi av Artsprosjekter skal i nært samråd med NorBOL gjøre et utvalg av innsamlet materiale tilgjengelig for DNA-strekkoding.
For materiale som skal analyseres skal helst 5 individer av hver art (eller antatt art) DNA-strekkodes, eventuelt gjøres tilgjengelig for DNA-strekkoding gjennom den nasjonale infrastrukturen Norwegian Barcode of Life Network (NorBOL), innenfor tidsrammen av prosjektet.
Individer som tilgjengeliggjøres for analyser gjennom NorBOL skal:
- bestemmes taksonomisk og oppbevares for seg i separate beholdere, eventuel subsamples (for eksempel bein for insekter)
- gis en unik kode og etiketteres fullstendig
- fotograferes etter en gitt mal
- ivaretas på en slik måte at DNA-kvaliteten bevares, dvs ved -20 grader og/eller spritfiksering (hele individet eller en vevsprøve) eller tørt (med bruk av silica gel)
- doneres som voucher-specimen (eventuelt inkluderten vevsprøve) med tilhørende relevant objektinformasjon til en offentlig vitesenskapelig samling (fortrinnsvis et museum innen NorBOL)
DNA-strekkoder og tilhørende data skal legges inn i den internasjonale databasen Barcode of Life Data Systems, eventuelt med hjelp fra NorBOL. Prosjektleder får tilgang til de aktuelle foldere i BOLD hvor prosjektet har bidratt med materiale.
Strekkodene til individene vil bli offentliggjort i GenBank sammen med informasjon om minimum land de er innsamlet i, samt taksonomisk tilhørighet ned til familie- eller ordensnivå, etter de rutiner som er etablert for prosjektet International Barcode of Life, hvor NorBOL er regional node.
Gå til:
- Norwegian Barcode of Life Network (NorBOL)
- Barcode of Life Data Systems
- International Barcode of Life
Kontaktperson i NorBOL
Torbjørn Ekrem
NTNU Vitenskapsmuseet
torbjorn.ekrem@ntnu.no
Tlf: 73597812
Rapportering Natur i Norge (NiN)
Natur i Norge (NiN) er Artsdatabankens system for å beskrive og systematisere naturen, fra store landskap til små livsmiljø. Når kartleggere i Artsprosjektet rapporterer naturtypetilknytning for arter/grupper, øker kunnskapen om art-habitatrelasjoner.
Innhold og praktisk gjennomføring
- Artsdatabanken har utarbeidet et excel-skjema for registrering av naturtyper for arter omfattet av Artsprosjektene. Prosjektleder bes ta kontakt for videre veiledning for sitt prosjekt.
- NiN 3.0 benyttes som beskrivelsessystem.
- Alle funn skal knyttes til naturtype, ikke bare nye funn for vitenskapen eller Norge.
- For mange rødlistearter finnes allerede god dokumentasjon om naturtypetilknytning, særlig skoglevende arter og arter knyttet til kulturmark. For disse artene er det ikke nødvendig å fylle inn naturtypeinformasjon. Kontakt Artsdatabanken om hvilke arter dette gjelder.
NiN-nivå som omfattes
- Ved registrering kan alle NiN-nivå angis: landskap, landskapsdel, natursystem og livsmedium.
- Natursystem eller livsmedium er som regel mest aktuelt, men for ferskvannsarter kan landskapsdel være hensiktsmessig.
- For skogarter kan det også være aktuelt å angi treslagsdominans og/eller skogtilstand.
- Beskrivelser skal være på overordnet nivå, f.eks. hovedtypenivå, da mange arter er dårlig kjente.
Praktisk registrering i Excel
- Registrer kun arter med navn i Nortaxa.
- Kryss av naturtypene som er viktige for ca. 80 % av bestanden i Norge.
- Minimumsdata i skjema:
- Vitenskapelig navn
- Vitenskapelig navn ID (scientificNameID, hent fra Navnevask-verktøyet)
- Datasettets navn (DatasetName) på formen "Artsprosjekt_XX-XX_prosjekttittel", hvor XX-XX er tilskuddsnummer for prosjektet
- Kunnskapsstatus på skala fra 0–5 (se omtale under)
- Naturtypene/livsmediet arten forekommer i/på
- Metadata legges i separat tekstfil.
Vurdering av kunnskapsstatus (0–5)
- 0: Ingen kunnskap om artens naturtypetilhørighet
- 1: Svært svak kunnskap, basert på spekulasjon eller utenlandske observasjoner
- 2: Svak kunnskap, basert på få norske observasjoner
- 3: Akseptabel kunnskap, basert på observasjoner eller vitenskapelige studier i Norge
- 4: God kunnskap, tilfredsstillende empiriske data for de fleste naturtyper
- 5: Sikker kunnskap, uttømmende og analysert
Kilder til variasjon
- NiN-systemet har kilder til variasjon som kan brukes, f.eks. eutrofieringsgrad, gjengroing, regionale økokliner eller treslagsdominans. Legg inn i egen kolonne hvis relevant.
Eksempelskjema:
Lenke til NiN 3.0:
Rapportering av stedsfestede funn
Funn av arter gjort i prosjekter som har fått tilskudd gjennom Artsprosjektet, skal kobles til prosjektet og gjøres tilgjengelige gjennom Artsdatabankens tjenester, som Artskart eller Artsobservasjoner.
Dette sikrer at dataene blir tilgjengelige for andre og dokumenterer prosjektets bidrag.
Slik gjør du:
Fyll inn prosjektets navn i feltet datasetName
- Format:
Artsprosjekt_tilskuddsnr_prosjekttittel(f.eks.Artsprosjekt_99-15_kartleggingsprosjekt-tittel). - Flere prosjekter kan skilles med |, f.eks.
Artsprosjekt_99-15_kartleggingsprosjekt-tittel | Overvåkning av slåtteeng.
Registrer stedsfestede funn
- Alle funn, inkludert bifangst, fra tilskuddsprosjekter skal registreres i Artskart eller Artsobservasjoner via institusjonen som eier objektet.
Revisjon av samlinger
- Digitaliser informasjon fra gjennomgang eller revisjon av samlinger, og fyll inn datasetName.
- Krediter personer som har revidert samlingen i feltet identifiedBy.
Lag Excel-fil med obligatoriske kolonner
institutionCode, collectionCode, catalogNumber, datasetName, basisOfRecord, eventDate, scientificName, decimalLatitude, decimalLongitude- Hvis koordinater er i UTM: fyll også inn
geodeticDatum.
Sluttrapportering
- Dokumenter at funnene er eller vil bli tilgjengelige i Artskart/Artsobservasjoner, enten ved å:
- Referere til funn merket med prosjektets navn i Artskart/Artsobservasjoner, eller
- Legge ved Excel-filen i sluttrapporteringsløsningen
- Hvis prosjektet har funn av nye arter som ikke kan deles innen prosjektperiodens slutt, last dem opp som Excel-fil.
Nye arter
- Rapporteres som sp. nov. (ined.) eller cf./aff. den arten de ligner mest.
- Oppdater navnet i databasen når det vitenskapelige navnet er publisert.
- Filene publiseres i Artskart/Artsobservasjoner så snart som mulig etter publisering.
Artsnavn
Artsnavn som rapporteres til Artskart skal være i samsvar med Artsdatabankens navneregister, Nortaxa.
- Gjennom navnevask-versktøyet «Navnevask» kan artslister fra prosjektet kontrolleres mot innholdet i navneregisteret.
Artsobservasjoner
- Prosjekt som rapporterer via Artsobservasjoner må opprette et nytt prosjekt der alle funn registreres.
- Prosjektnavnet skal følge samme format som ved rapportering i Artskart, dvs.
Artsprosjekt_tilskuddsnr_prosjekttittel. - Ved sluttrapportering skal alle funn eksporteres og lastes opp som Excel-fil.
- Funn rapportert til Artsobservasjoner eies av den frivillige organisasjonen som registrerer dem, f.eks. Norsk entomologisk forening.
Levere data til bestemmelsesnøkler
Her finner du retningslinjer for hvordan du kan levere data til digitale bestemmelsesnøkler. Teksten beskriver hvordan arter, egenskaper og annen relevant informasjon registreres, slik at nøklene blir korrekt strukturert, brukervennlige og tilgjengelige for forskning og undervisning.
Åpne lisenser
Vi bruker åpne lisenser ved avtaler om dataleveranser, noe som sikrer rettighetene til både brukeren og leverandøren av materialet. Om åpne lisenser