Levere data til Artsprosjektet
Som del av Artsprosjektet er det viktig å dele artsfunn på en strukturert måte. Her finner du retningslinjer for rapportering, datalevering, artsnavn og lisenser, slik at dataene dine blir en verdifull ressurs for forskning, forvaltning og naturmangfold i Norge.
Innhold
DNA-strekkoder
Alle kartleggingsprosjekter i regi av Artsprosjekter skal i nært samråd med NorBOL gjøre et utvalg av innsamlet materiale tilgjengelig for DNA-strekkoding.
For materiale som skal analyseres skal helst 5 individer av hver art (eller antatt art) DNA-strekkodes, eventuelt gjøres tilgjengelig for DNA-strekkoding gjennom den nasjonale infrastrukturen Norwegian Barcode of Life Network (NorBOL), innenfor tidsrammen av prosjektet.
Individer som tilgjengeliggjøres for analyser gjennom NorBOL skal:
- bestemmes taksonomisk og oppbevares for seg i separate beholdere, eventuel subsamples (for eksempel bein for insekter)
- gis en unik kode og etiketteres fullstendig
- fotograferes etter en gitt mal
- ivaretas på en slik måte at DNA-kvaliteten bevares, dvs ved -20 grader og/eller spritfiksering (hele individet eller en vevsprøve) eller tørt (med bruk av silica gel)
- doneres som voucher-specimen (eventuelt inkluderten vevsprøve) med tilhørende relevant objektinformasjon til en offentlig vitesenskapelig samling (fortrinnsvis et museum innen NorBOL)
DNA-strekkoder og tilhørende data skal legges inn i den internasjonale databasen Barcode of Life Data Systems, eventuelt med hjelp fra NorBOL. Prosjektleder får tilgang til de aktuelle foldere i BOLD hvor prosjektet har bidratt med materiale.
Strekkodene til individene vil bli offentliggjort i GenBank sammen med informasjon om minimum land de er innsamlet i, samt taksonomisk tilhørighet ned til familie- eller ordensnivå, etter de rutiner som er etablert for prosjektet International Barcode of Life, hvor NorBOL er regional node.
Gå til:
- Norwegian Barcode of Life Network (NorBOL)
- Barcode of Life Data Systems
- International Barcode of Life
Kontaktperson i NorBOL
Torbjørn Ekrem
NTNU Vitenskapsmuseet
torbjorn.ekrem@ntnu.no
Tlf: 73597812
Rapportering Natur i Norge (NiN)
Natur i Norge (NiN) er Artsdatabankens system for å beskrive og systematisere naturen, fra store landskap til små livsmiljø. Når kartleggere i Artsprosjektet rapporterer naturtypetilknytning for arter/grupper, øker kunnskapen om art-habitatrelasjoner.
Innhold og praktisk gjennomføring
- Artsdatabanken utarbeider, i samarbeid med prosjektleder, et excel-skjema for registrering av naturtyper for arter omfattet av Artsprosjektene.
- NiN 2.0 benyttes som beskrivelsessystem. Kontakt Artsdatabanken før feltarbeid for å få skjema klart.
- Alle funn skal knyttes til naturtype, ikke bare nye funn for vitenskapen eller Norge.
- For mange rødlistearter finnes allerede god dokumentasjon om naturtypetilknytning, særlig skoglevende arter og arter knyttet til kulturmark. For disse artene er det ikke nødvendig å fylle inn naturtypeinformasjon. Kontakt Artsdatabanken om hvilke arter dette gjelder.
NiN-nivå som omfattes
- Ved registrering kan alle NiN-nivå angis: landskap, landskapsdel, natursystem og livsmedium.
- Natursystem er som regel mest aktuelt, men for ferskvannsarter kan landskapsdel være hensiktsmessig, og for marine arter kan landskap være relevant.
- For skogarter kan det også være aktuelt å angi treslagsdominans og/eller skogtilstand.
- Beskrivelser skal være på overordnet nivå, f.eks. hovedtypenivå, da mange arter er dårlig kjente.
Praktisk registrering i Excel
- Registrer kun arter med navn i Artsnavnebasen.
- Kryss av naturtypene som er viktige for ca. 80 % av bestanden i Norge.
- Minimumsdata i skjema:
- Vitenskapelig navn
- Vitenskapelig navn ID (scientificNameID, hent fra Navnevask-verktøyet)
- Datasettets navn (DatasetName)
- Vurdering av kunnskapsstatus (0–5)
- Naturtypene arten forekommer i
- Metadata legges i separat tekstfil.
Vurdering av kunnskapsstatus (0–5)
- 0: Ingen kunnskap om artens naturtypetilhørighet
- 1: Svært svak kunnskap, basert på spekulasjon eller utenlandske observasjoner
- 2: Svak kunnskap, basert på få norske observasjoner
- 3: Akseptabel kunnskap, basert på observasjoner eller vitenskapelige studier i Norge
- 4: God kunnskap, tilfredsstillende empiriske data for de fleste naturtyper
- 5: Sikker kunnskap, uttømmende og analysert
Kilder til variasjon
- NiN-systemet har kilder til variasjon som kan brukes, f.eks. eutrofieringsgrad, gjengroing, regionale økokliner eller treslagsdominans. Legg inn i egen kolonne hvis relevant. Ta kontakt hvis skjemaet må tilpasses.
Eksempelskjema
Rapportering av stedsfestede funn
Funn av arter gjort i prosjekter som har fått tilskudd gjennom Artsprosjektet, skal kobles til prosjektet og gjøres tilgjengelige gjennom Artsdatabankens tjenester, som Artskart eller Artsobservasjoner.
Dette sikrer at dataene blir tilgjengelige for andre og dokumenterer prosjektets bidrag.
Slik gjør du:
Fyll inn prosjektets navn i feltet datasetName
- Format:
Artsprosjekt_kontraktsnr_prosjekttittel(f.eks.Artsprosjekt_99-15_kartleggingsprosjekt-tittel). - Flere prosjekter kan skilles med |, f.eks.
Artsprosjekt_99-15_kartleggingsprosjekt-tittel | Overvåkning av slåtteeng.
Registrer stedsfestede funn
- Alle funn fra tilskuddsprosjekter skal registreres i Artskart eller Artsobservasjoner på institusjonen som eier objektet.
Revisjon av samlinger
- Digitaliser informasjon fra gjennomgang eller revisjon av samlinger, og fyll inn datasetName.
- Krediter personer som har revidert samlingen i feltet identifiedBy.
Lag Excel-fil med obligatoriske kolonner
institutionCode, collectionCode, catalogNumber, datasetName, basisOfRecord, eventDate, scientificName, decimalLatitude, decimalLongitude- Hvis koordinater er i UTM: fyll også inn
geodeticDatum.
Sluttrapportering
- Dokumenter at funnene er eller vil bli tilgjengelige i Artskart/Artsobservasjoner, enten ved å:
- Legge ved Excel-filen i sluttrapporteringsløsningen, eller
- Referere til funn merket med prosjektets navn i Artskart/Artsobservasjoner.
- Hvis prosjektet har funn av nye arter som ikke kan deles innen prosjektperiodens slutt, last dem opp som Excel-fil.
Nye arter
- Rapporteres som sp. nov. (ined.) eller cf./aff. den arten de ligner mest.
- Oppdater navnet i databasen når det vitenskapelige navnet er publisert.
- Filene publiseres i Artskart/Artsobservasjoner så snart som mulig etter publisering.
Artsnavn
Artsnavn som rapporteres til Artskart skal være i samsvar med Artsdatabankens navneregister.
- Gjennom navneoppslagstjenesten «Navnevask» kan artslister fra prosjektet kontrolleres mot innholdet i navneregisteret.
Artsobservasjoner
- Prosjekt som rapporterer via Artsobservasjoner må opprette et nytt prosjekt der alle funn registreres.
- Prosjektnavnet skal følge samme format som Artskart.
- Ved sluttrapportering skal alle funn eksporteres og lastes opp som Excel-fil.
- Funn rapportert til Artsobservasjoner eies av den frivillige organisasjonen som registrerer dem, f.eks. Norsk entomologisk forening.
Levere data til bestemmelsesnøkler
Her finner du retningslinjer for hvordan du kan levere data til digitale bestemmelsesnøkler. Teksten beskriver hvordan arter, egenskaper og annen relevant informasjon registreres, slik at nøklene blir korrekt strukturert, brukervennlige og tilgjengelige for forskning og undervisning.
Åpne lisenser
Vi bruker åpne lisenser ved avtaler om dataleveranser, noe som sikrer rettighetene til både brukeren og leverandøren av materialet. Om åpne lisenser