Alpehumle kan forveksles med polarhumle, selv om sistnevnte oftest er noe mindre. Tidlig på sommeren, før de blekes, kan dronninger lett bestemmes på den mørke oransjerøde fargen på bakkroppen. Senere på sommeren blir imidlertid alpehumle og polarhumle mer like i fargen. Overflaten av leggene (tibiae) på bakbeina er glinsende hos alpehumle (se bilde av bakre legg), mens den hos polarhumle er matt pga. kraftig mikrochagrinering. Arbeidere av de to artene har likt fargemønster og er noen ganger ikke mulige å artsbestemme sikkert i felten. Behåringen på T2 er oftest helt rød hos alpehumle, mens den hos polarhumle har tydelige innslag av svarte hår på fremre del av T2 slik at fargeovergangen mellom svart og rødt blir mer diffus.

Arbeidere av alpehumle kan lett forveksles med dronninger av lapphumle (sørlig form) og berghumle som kan ha samme størrelse og fargemønster. Disse kan skilles fra alpehumle (og polarhumle) på at de mangler en tydelig utstående pigg nederst på utsiden av bakre tibia. Arbeidere av alpehumle har dessuten et litt lengre ansikt (se bilde av framkropp). Dette kan måles ved at kinnlengden (avstand mellom øyets nedre kant og basis av kjeven), er større enn kinnbredden ved basis av kjeven (a>b på illustrasjon av humlehode). Dessuten er formen på kjevene litt forskjellig. Alpehumle og polarhumle har dessuten mer konveks form på munnskjoldet (clypeus) enn lapphumle og berghumle.

Hanner av alpehumle kan best skilles fra hanner av polarhumle på den helrøde fargen på T2. Polarhumle har flere svarte hår på T2 og mer diffus overgang mot det røde. Hannene kan også skilles på formen av volsella på genitaliene (se bilde av ytre volsella), men for å forstå disse forskjellene anbefales det at man har tilgjengelig begge arter for sammenligning. Den beste og enkleste karakteren for å skille disse to artene er å se på utformingen av siste indre bukledd (St8). Dette leddet har hos alpehumle en butt avrundet spiss (se bilde av sternitt 8), mens det hos polarhumle er utstrekt i en spiss som er innbuktet på sidene. Leddets utforming kan imidlertid variere noe og bildene representerer gjennomsnittsindivider.